A coordenação pedagógica é formada por uma equipe de cinco educadores que buscam garantir o segmento da filosofia e da proposta pedagógica do Colégio Carpe Diem.
Semanalmente, a equipe se reúne com os professores para discussão, análise e aprimoramento das práticas e ações pedagógicas. Encontros individuais, coletivos e em subgrupos garantem o desenvolvimento de um trabalho pedagógico sério e comprometido.